Chapitre 9 Documenter ses pratiques

Cette partie expose une sélection de solutions aux problèmes soulevés dans le chapitre 4.

9.1 Rédiger un protocole de collecte des informations

Comme nous l’avons vu plus haut (chapitres 4 et 5), l’information doit être collectée de façon “standardisée”. Cela implique de rédiger un protocole décrivant la façon dont l’information est collectée, et ce, donnée par donnée. Par exemple : chez une personne atteinte d’un diabète, vous recueillez la concentration du glucose dans le sang. Vous devez dès lors rédiger le protocole permettant d’obtenir la valeur de la concentration en glucose, en précisant notamment dans le protocole le volume de sang prélevé, à quel moment de la journée est-il prélevé, etc. Ce protocole doit non seulement être rédigé mais il doit par ailleurs être approuvé par votre équipe de recherche, ou a minima, par les personnes de votre équipe disposant des compétences pour juger de la qualité de ce protocole.

9.2 Partager le protocole de collecte des données

Idéalement, le protocole de collecte des informations devrait faire partie de l’article publié qui relate les résultats de votre recherche. Dans un monde idéal encore, les revues devraient systématiquement demander aux auteurs de rédiger une telle partie dans l’article afin que d’autres chercheurs puissent éventuellement confirmer les résultats de votre étude. A noter : il ne s’agit pas forcément de rédiger in extenso le protocole de collecte des informations dans l’article. Il s’agit plutôt de se demander si, sur la base de votre descriptif, un tiers pourrait appliquer votre protocole de collecte de données et obtenir in fine des résultats similaires aux vôtres.

9.3 Tenir un cahier de laboratoire

Modifier des informations ne constitue pas en soi un problème. Les difficultés surviennent lorsque ces modifications n’ont pas été documentées, tracées. Une solution pour pallier ce problème consiste à rédiger un cahier de laboratoire. A l’origine, un cahier de laboratoire est un document physique dans lequel on consigne toute modification d’information au stylo (indélébile) : on indique la raison de la modification de la valeur d’une information, la date de la modification, et l’auteur de la modification. Même si le cahier physique a tendance à disparaître des laboratoires au profit de carnets de laboratoire numériques, la logique reste la même : toute modification des informations initiales doit être renseignée, en indiquant la raison de la modification, la date, et l’auteur de la modification.
Le tableur est-il mon ami pour effectuer ce type de tâche ? Pas vraiment. Plutôt pas du tout, dans la mesure où la modification d’une valeur dans une cellule peut être réalisée sans laisser de trace.

9.4 Collecter les données de façon répétable ET reproductible

Le protocole de collecte d’une information doit être défini de telle sorte qu’elle soit “répétable” et “reproductible” au sens du VIM (Bureau International des Poids et des Mesures 2012) (cf. chapitre 4). Tout d’abord, si vous collectez une information deux fois sur un individu dans un intervalle de temps restreint, les deux valeurs de l’information doivent être les mêmes, ou du moins être suffisamment voisines pour être “considérées” comme identiques (condition de répétabilité). La collecte des informations doit être reproductible entre opérateurs (on parle de “reproductibilité inter-opérateurs” ). Pour garantir une bonne répétabilité et reproductibilité inter-opérateurs, il faut donc avoir standardisé au maximum le protocole de collecte des données, en s’appuyant sur un instrument de mesure capable de recueillir les informations avec le minimum d’erreurs possibles. Des indicateurs statistiques, tels que les coefficients de concordance, permettent de quantifier la “répétabilité” ou la “reproductibilité inter-opérateurs” d’une méthode de mesure.

9.5 Pour en savoir plus

Pour en savoir plus sur les cahiers de laboratoire, nous vous invitons à consulter le site du CNRS (CNRS 2019). Pour en savoir plus sur la quantification de la répétabilité et de la reproductibilité de la façon dont on collecte les données, vous pouvez consulter le document suivant : “Guide pratique de validation statistique de méthodes de mesure : répétabilité, reproductibilité, et concordance” (Desquilbet 2019).

Références

Bureau International des Poids et des Mesures. 2012. “Vocabulaire International de Métrologie – Concepts Fondamentaux et Généraux et Termes Associés.” JCGM 200:2012. Sèvres: Bureau International des Poids et des Mesures. https://www.bipm.org/utils/common/documents/jcgm/JCGM_200_2012.pdf.

CNRS. 2019. “Le Cahier de Laboratoire.” Informations Aux Laboratoires CNRS. http://www.cnrs.fr/infoslabos/cahier-laboratoire/.

Desquilbet, Loïc. 2019. “Guide Pratique de Validation Statistique de Méthodes de Mesure : Répétabilité, Reproductibilité, et Concordance.” Maison Alfort: Ecole Nationale Vétérinaire Maison Alfort. https://bit.ly/2ZKcQGL.